AMU-Fyns mission er todelt, men stærkt komplementær:

Sikre AMU-Fyns målgruppe en fremtidsrettet faglig og personlig opkvalificering, således at deres værdi på arbejdsmarkedet optimeres
Sikre at virksomhederne til enhver tid kan få deres uddannelsesbehov dækket inden for AMU-Fyns målgrupper.
  
AMU-Fyns vision er:

AMU-Fyn ønsker at være et kompetencecenter inden for voksen- og efteruddannelsesområdet med speciel fokus på de tre kerneområder:
Praksisnær kompetenceudvikling
Omstillingsparathed i forhold til arbejdsmarkedets behov
Optimal individuel virksomhedstilpasning.